Στις 24/6/08 ο πρύτανης κ. Κουσκουβέλης κάλεσε τα μέλη του Ειδικού Σώματος των Εκλεκτόρων να συμμετάσχουν στην εκλογή Προέδρου/Αντιπροέδρου στο Τμήμα Εφ.Πληροφορικής. Η εκλογική διαδικασία διεκόπη μετά από βίαιη παρέμβαση ομάδας φοιτητών. Στις 27/6/08 η ΓΣ του Τμήματος Εφ. Πληροφορικής με ομόφωνη απόφασή της ζητά από την Πρυτανεία τη συνέχιση της διαδικασίας εκλογής Προέδρου του Τμήματος και όχι τον διορισμό του από τη Σύγκλητο. Αυτό συνέβη για άλλα τμήματα που αντιμετώπισαν το ίδιο πρόβλημα. Αντίθετα, για το τμήμα Εφ. Πληροφορικής, στις 13/10/08 η Πρυτανεία προσκάλεσε τα μέλη της Συγκλήτου σε έκτακτη συνεδρίαση την Τρίτη 14/10/08 με μοναδικό θέμα το διορισμό προσωρινού Προέδρου. Ο πρύτανης προέβαλε αστείες δικαιολογίες για την διαφορετική αντιμετώπιση του τμήματος αυτού. Δημιουργείται επομένως η εύλογη υποψία ότι ο πρύτανης έδρασε με δόλο έτσι ώστε να διοριστεί στο τμήμα ο πρόεδρος που ο ίδιος επιθυμούσε.http://greekuniversityreform.wordpress.com